Вибирається керівник аудиторського процесу. У його обов’язки входить забезпечення бюджетними й іншими ресурсами для проведення аудиту, контакти із зацікавленими організаціями, наприклад, муніципальною комісією з питань охорони навколишнього середовища, відбір і підготовка аудиторського персоналу, коректування аудиторської програми відповідно до попередніх результатів аудиту або існуючої інформації, контроль за дотриманням цілей і норм екологічного аудиту.
Члени аудиторської команди повинні знати закони й інші нормативні акти, що мають відношення до природоохоронної діяльності, політику міської адміністрації в сфері охорони природи, процедури вирішення екологічних питань на муніципальному рівні. Члени аудиторської команди повинні мати уявлення про способи контролю за екологічною й санітарно-епідеміологічною безпекою. На початкових стадіях аудиту основну увагу привертає до себе діяльність муніципальних органів з контролю викидів і скидів, очистки стічних вод, тому аудитор повинен практично знати процедури екологічного моніторингу. Можливе залучення фахівців у різних областях.
Оскільки аудиторська команда повинна бути незалежною від об’єкта ЕА, рекомендується залучати незалежних аудиторів. Однак група повинна тісно співпрацювати з муніципальними службами, тому аудитори повинні мати достатню інформацію про місцеві умови, для того щоб зав’язати необхідні контакти.
